锌的代谢受许多因素影响，锌与各种营养素间也有相互作用。
锌与蛋白质的相互作用。锌参与蛋白质的合成，锌还能促进线粒体内能量的生成,为合成蛋白质提供能源。锌与生物膜的脂蛋白有特殊亲和力。血浆白蛋白分子带有较多的极性基团, 对二价锌离子有较强的亲和力, 通过可逆结合可发挥它们的运输作用。此外, 某些组织中含硫氨基酸的掺入也需要锌的参与。蛋白质和氨基酸有助于锌的吸收，但是大豆蛋白会妨碍锌的吸收。
锌与维生素间的相互作用。锌可稳定生物膜, 能抑制生物膜上的脂质过氧化及巯基氧化的作用, 从而与维生素E一起对细胞膜的保护起协同作用。锌在体内还能促进视黄醇结合蛋白质的合成, 参与维生素A的代谢, 促进维生素A自肝脏动员出来，以维持血浆维生素A的正常浓度。
锌与铜、铁、钙间的作用。锌和铜在肠粘膜或金属硫蛋白中可以相互竞争结合部位, 在吸收时可产生相互抑制。锌与铁相抑制其在肠粘膜上的吸收,补充锌后可以降低体内血液、肾脏及肝脏内铁的含量。要注意的是，高摄入量的钙会影响锌吸收，因为锌在有较多钙的情况下, 可与粮谷类食品或豆类食品中含量较高的植酸盐结合, 形成完全不溶解的锌钙肌醇六磷酸复合物，因此，锌与钙相互作用，影响吸收。
锌与植物纤维、植酸盐间的作用。植物纤维形状不定, 并且具备类似海绵的作用, 锌进入其空间结构后即被隔开, 不易与肠粘膜密切接角。植物纤维的主要成分与锌形成稳定的复合物或难溶性的复合物, 妨碍锌的吸收。
